1. 译名是怎么来的？用意如何？
拉丁文直译：
Enterococcus faecium（屎肠球菌）Enterococcus faecalis （粪肠球菌）的拉丁名其实就是同义词。faec-这个词根在英语也用，比如faeces（常拼做feces），就是粪便的意思。-ium，-alis是两种科学术语常用的名词后缀，本身是没有什么实际含义。
也就是说faecium和faecalis实际上是一个意思，都是指粪便，也就是同义词。那在翻译的时候也只好找一对同义词，都指粪便的，“屎”和“粪”就很合适。
2. 会不会产生混淆？
当然会。
但是这个问题是拉丁名导致的。Enterococcus faecium的Wikipedia上写着“Not to be confused with Enterococcus faecalis.”，Enterococcus faecalis那页也写了同样的话。
3. 为什么会出现这么混乱的拉丁命名呢？
既有客观原因，也有历史原因。
两种菌都是常见的偏离共生的肠道微生物。到1990年，在临床分离中，faecalis（粪肠球菌）占比90-95%，而faecium（屎肠球菌）为5-10%，历史上faecalis远远多于faecium，这是客观原因。
对人的肠道微生物的研究不可避免的会先发现占比大的优势种，然后才越来越精细发现比例小的其他物种。所以由于物种发现的先后顺序，其实经常会出现命名不合适的尴尬情况。这是历史原因。
历史上faecalis也的确是先发现的。
1899年的时候Thiercelin and Jouhaud发现在有一大类微生物和Bacterium coli (今天被广泛用作模式生物的E.coli，肠道微生物里面的一个优势种，也是早被发现的肠道微生物之一）一起在胃肠道内广泛生长，并提出了今天使用的Enterococcus肠球菌的属名（原文使用Enterocoque）。同一时间MacCallum and Hastings从一例心内膜炎的病理中分离了致病菌，命名为Micrococcus zymogenes，也就是后来的E. faecalis。
1906年Andrewes and Horder使用了Streptococcus faecalis这个名字，并确认是粪便来源的，得到了和M&H相似的观察，从而确认是同一种菌，使用faecalis这个名字，是为了强调细菌本身是一种肠道微生物（尽管开始的发现是在心内膜炎）。当时链球菌属，就这么一款粪便来源的微生物，用faecalis命名非常合适。
而早期的形态学观察并没有分离出faecium，实际上，从菌落形态上区分这两种菌是挺困难的。直到1919年Orla-Jensen发表的发酵研究才描述了Streptococcus faecium，辨别的方式是发酵类型的细微差别。比如faecium不能发酵甘露醇上，而faecalis可以。因为faecium也是粪便来源的微生物，也没有什么天赋异禀的特征可以用来命名，所以暂时命名成faecium也不奇怪。如果命名成“粪便来源不能发酵甘露醇链球菌”，一个词显然放不下……如果为了迁就faecium，就改了faecalis的名儿——人家先命名的都用了十多年了凭啥跟着你改。
但这种命名的确还是有点不负责任的，太容易混淆了。怎么解决这个问题？
Sherman是一个研究链球菌的科学家，也是他开始建立了enterococcal group的框架（1937年），也发展成后来的肠球菌属。Sherman的分类中，认为faecium和faecalis实际上是一个物种，所以这事就这样解决了…………大事化小小事化了。
直到1960年前后，faecium才被确认，的确是另一个物种啊。
然而这时候，除了发酵类型还是没有很好的方式区分两个物种，而这两个名字都已经用了半个世纪了，研究这个领域的人完全没有ium，alis傻傻分不清楚的困扰。既然没有更好的命名方式的提出来，于是又理所应当地继续沿用下去了。贸然改名，只会造成新的混乱。
在1984年，人们通过遗传学手段发现，enterococcal group这一群和其他的链球菌亲缘关系太远了，所以干脆，就升一档，成立肠球菌属，也就是沿用至今的Enterococcus faecium（屎肠球菌）Enterococcus faecalis（粪肠球菌）的两个拉丁名。这里改名一方面是因为的确有理有据，另一方面，肠球菌的概念也用了很久了半个世纪了，新命名不太会引起混乱。
【1】虽然历史上faecalis远远多于faecium，但是现在的临床分离中，faecium的比例越来越高。主要原因是耐药性的广泛传播，使得在抗生素筛选之下faecium有更强的适应度。
【2】两种菌在血平板上的菌落形态还是可以明显区分的。的确这也是目前常用的除了甘露醇高盐平板之外的鉴别手段之一。
另外，还要厘清的一点是，Sherman的那个年代可能是没有这种经验可以参考的。现在使用的琼脂培养基（Agar plate）虽然可以追溯到1881 Wlather Hesse，但是各种配方的特殊培养基诞生的时间是各有先后的。血平板技术，目前能查到的早的记录，是Bulloch’s 1938 The History of Bacteriology——“Agar poured out in a thin layer in a Petri dish may be smeared with blood in the same way and used for culture. ”文章里描述了血平板配置的各种方式，但也只是建议来用来研究病原菌，当时可能还不是一种成熟的通用技术。
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